С 1990 года, с момента когда была учреждена должность президента Республики Молдова, закон о выборе главы государства менялся несколько раз. Изначально, президент избирался Парламентом, затем - путем прямого голосования населения. С 2000 года, после внесения поправок в статью 78-ую Конституции, глава государства избирается Парламентом. Кандидат должен набрать минимум 61 голос.

В 1990 году был избран первый президент Республики Молдова Мирча Снегур. Через год, после провозглашения независимости, Снегур был переизбран путем прямого голосования. 1 декабря 1996 года во втором туре выборов главы государства, набрав 54 процента голосов избирателей, победу одержал Петр Лучинский. 7 января 1997 года Лучинский заступил на должность президента.

5 июля 2000 года в Конституцию были внесены изменения, согласно которым глава государства избирался Парламентом. В декабре этого же года, с трех попыток Парламент не смог избрать президента страны. Законодательный орган был распущен, и были назначены досрочные парламентские выборы. 4 апреля 2001 года новым главой государства стал Владимир Воронин, за которого проголосовал 71 депутат-коммунист. Через 4 года Воронин был переизбран 75-тью голосами коммунистов, христиан-демократов, демократов и социал-либералов. 20 мая и 3 июня 2009 года обе попытки правящей партии коммунистов выдвинуть на пост президента Зинаиду Гречаную провалились. Коммунистам в Парламенте принадлежало 60 мандатов, а не 61, как требовалось. Остальные партии отказались голосовать за Гречаную. В результате законодательный орган был распущен, были объявлены досрочные парламентские выборы. После них сформировалось новое парламентское большинство.

10 ноября 2009 года на должность президента была предложена кандидатура лидера Демократической Партии Мариана Лупу. За него проголосовали 53 депутата правящей коалиции. То же произошло и 7 декабря, когда Альянс за Европейскую Интеграцию снова сделал попытку избрать Лупу на пост главы государства.