Высший совет магистратуры обеспечивает независимость судебной системы в Молдове. Среди полномочий структуры - подготовка судей и контроль за соблюдением ими дисциплины и этики.

Совет принимает решения относительно утверждения или отклонения кандидатов на должность судей, оценивает их работу и рассматривает жалобы относительно их деятельности.

Помимо этого, ВСМ руководит судебными инстанциями и хранит личные дела судей. Он может уведомить парламент, главу государства и правительство по любым вопросам, входящим в его компетенцию, и сотрудничать с аналогичными учреждениями других стран.

Высший совет магистратуры обязан составлять годовые отчеты о своей деятельности и работе судебной системы в целом и публично представлять их перед общим собрание судей.