Гагаузия является автономным территориальным образованием в составе Молдовы с особым правовым статусом. Основным ее законом является Уложение Гагаузии. В документе предусмотрено, что всё происходящее на территории региона проводится в соответствии с Конституцией Республики Молдова.

Власти автономии, в пределах своей компетенции, решают вопросы политического, экономического и культурного характера.

Высшим должностным лицом Гагаузии является башкан. Он избирается сроком на 4 года путем всеобщего голосования. Президентским указом, глава Гагаузии утверждается членом правительства Молдовы.

Законодательный орган автономии - Народное собрание, у которого есть право выдвигать законодательные инициативы в парламенте страны. В Народном собрании 35 депутатов, избираемых сроком на четыре года. К компетенции Народного собрания относится принятие нормативных актов, а также участие в осуществлении внутренней и внешней политики Молдовы по вопросам, касающихся интересов Гагаузии.

Постоянно действующим исполнительным органом автономии является Исполнительный комитет, который утверждается Народным собранием также на четырехлетний срок. Им руководит башкан автономии.

Центральная избирательная комиссия занимается организацией и проведением выборов на территории региона. Состав ЦИКа утверждается Народным собранием, а девять членов учреждения являются представителями законодательной, исполнительной и судебной властей.

Статус Гагаузии не может быть изменен без согласия жителей автономии. В случаи изменения статуса Молдовы, гагаузский народ имеет право на внешнее самоопределение.