Агирре принял решение покинуть свой пост после поражения мексиканцев в 1/8 финала чемпионата мира с Аргентиной. Он проработал наставником сборной Мексики менее полутора лет.

Агирре возглавил мексиканскую команду в апреле 2009 года и вывел ее на чемпионат мира-2010 в ЮАР. На первенстве мира сборная Мексики заняла второе место в группе A, пропустив вперед Уругвай и опередив команды ЮАР и Франции.